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一个新模型解释了自然界中DNA的大小差异|世界速看料

发布时间: 2023-02-23 14:45:58 来源:互联网


(资料图片)

特拉维夫大学开发的一种新模型为科学问题提供了可能的解决方案,即为什么中性序列(有时被称为“垃圾 DNA”)不会从自然界生物的基因组中消除,并继续存在于其中甚至数百万多年后。

根据研究人员的说法,解释是垃圾 DNA 通常位于功能 DNA 附近。垃圾和功能 DNA 之间边界周围的删除事件可能会损坏功能区域,因此进化会拒绝它们。该模型有助于了解在自然界中观察到的基因组大小的巨大差异。

新模型描述的现象被研究团队称为“边界诱导选择”。它是在生命科学学院 Shmunis 生物医学和癌症研究学院 Tal Pupko 教授实验室的博士生 Gil Loewenthal 的领导下,与 Itay Mayrose 教授(特拉维夫生命科学学院)合作开发的大学)。该研究发表在《开放生物学》杂志上。

研究人员解释说,在整个进化过程中,自然界生物的基因组大小会发生变化。例如,某些蝾螈​​物种的基因组比人类基因组大十倍。

Pupko 教授解释说:“缺失和短插入率,简称为‘插入缺失’,通常通过检查假基因来测量。假基因是已经失去功能的基因,其中经常发生突变,包括缺失DNA 片段的插入和插入。在之前对插入缺失进行表征的研究中,发现在包括细菌、昆虫,甚至哺乳动物(如人类)在内的多种生物中,缺失的速率大于添加的速率。我们尝试的问题答案是当 DNA 删除事件的概率明显大于 DNA 添加事件时,基因组是如何不被删除的。”

border-induced selection”并将模拟结果与人类内含子长度的分布进行比较(内含子是蛋白质编码基因中间的 DNA 片段,它们本身不编码蛋白质)。模拟结果与自然界中观察到的长度分布吻合良好,我们能够解释内含子长度分布中的奇特现象,例如内含子长度的巨大变化,以及复杂的形状看起来不像标准钟形曲线的分布”

标签: 生命科学学院 基因组大小 研究人员 模拟结果

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